Supreme Commander

Supreme Commanderissa on kaksi resurssia: massa ja energia. Massaa hankitaan poraamalla sitä massaesiintymistä sekä energiaa massaksi muuntavilla laitteilla. Energiaa hankitaan rakentamalla energiantuotantolaitoksia. Resursseja voi varastoida vain rajatun määrän, jonka jälkeen ylimääräiset menevät hukkaan. Resurssit ovat loputtomia.

Mikäli esimerkiksi tehdasrakennus on resurssientuotantorakennuksen vieressä, se saa bonusta alennettujen rakennuskustannusten muodossa.

Pelissä käytetään "strategista zoomausta", eli näkymän pystyy laajentamaan koko pelialueen käsittäväksi, jolloin yksiköt näkyvät taktisina merkkeinä. Myös aivan lähelle maanpintaa voi lähentää. Tämä mahdollistaa Supreme Commanderin suuren mittakaavan; pelaajalla voi olla jopa tuhat yksikköä kentällä. Yksiköt ovat realistisen kokoisia; esimerkiksi taistelulaiva on paljon suurempi kuin sukellusvene. Suurimmat kokeelliset yksiköt voivat jopa murskata pienempiä tankkeja alleen.

Erilaisia ympäristöjä on arktisista alueista aavikkoon. Pelissä käytetään paljon nykyaikaisen sodankäynnin tekniikkaa, kuten tutkanhäirintäjärjestelmiä, taktisia risteilyohjuksia ja yksikköjen ilmakuljetusta. Komentosysteemi sallii esimerkiksi koordinoitujen hyökkäysten tekemisen, jolloin eri suunnista hyökkäävät yksiköt tulevat samaan aikaan paikalle.

United Earth Federation eli UEF (Yhdistynyt Maan Federaatio) edustaa Maapallolta hallittua, Maan Imperiumin jäännettä. UEF:n tavoitteena on yhdistää ihmiskunta jälleen hallitsemaan galaksia. Sen sotilastaktiikat ja yhteiskuntarakenne muistuttavat eniten nykyhetken ihmiskuntaa. UEF:n "pimeitä puolia" ovat esimerkiksi eräänlaisen orjuuden hyväksyminen.

Cybran Nation (Cybranien Kansakunta) koostuu symbionteista eli ihmisistä, joiden aivoja on paranneltu tietokoneteknologialla. Cybranit taistelevat vapauttaakseen kaikki symbiontit UEF:n vallasta. Kansakuntaa johtaa tohtori Brackman, joka alun perin kehitti tekniikan, jolla aivot yhdistetään tietokoneeseen, ja on isähahmo kaikille symbionteille.

Aeon Illuminate (Ikiaikaiset Valaistuneet) ovat niiden jälkeläisiä, jotka saivat ensikosketuksen alienrotu Seraphimiin. Seraphim-rotu kertoi ihmisille heidän elämänkatsomuksestaan (The Way, Tie). Maan Imperiumin xenofobian ansiosta Seraphimit hävitettiin oletetusti sukupuuttoon. Heidän paikalleen nousivat opetuksia noudattavat Aeonit. He aloittivat suurhyökkäyksen galaksiin "puhdistaakseen" kaikki, jotka eivät noudattaneet "Tietä".

Alussa kerrotaan, kuinka osapuolet olivat sotineet keskenään yli tuhat vuotta. Kaikilla on omat ongelmansa; UEF on heikentynyt sodassa, Cybraneiden voimavarat ovat kuluneet ja Aeonien pääkomentaja aiheuttaa levottomuutta. Juoni kehittyy UEF:n rakentaman Black Sunin, planeetantuhoajan, ympärille. Kaikki osapuolet yrittävät saada sen haltuunsa käyttääkseen sitä omiin tarkoituksiinsa. Cybranit haluavat lähettää kvanttiporttiverkostoon kvanttiviruksen ja Aeonit haluavat lähettää rauhanviestin ihmisten mieliin kvanttiverkoston kautta.

UEF käyttää Black Sunia tuhoamaan Cybranien ja Aeonien tärkeimmät planeetat, jonka jälkeen se pystyy lopettamaan loputtoman sodan ja yhdistämään ihmiskunnan.

Cybranien päätietokone, QAI, lähettää kvanttiverkostoon viruksen, joka sammuttaa kaikki kvanttiportit viideksi vuodeksi, jonka aikana symbiontit pystyvät kehittymään ilman vihamielisten hyökkäyksiä.

Aeonit yhdistävät prinsessansa verkostoon. Prinsessa puhuu kaikille ihmisille suoraan heidän mieliinsä, ja saa sodan loppumaan.

Pelin lopuksi jokaisella osapuolella on omanlaisensa loppu. Cybranien lopussa QAI näkee tunnistamattomien vihollisten tulevat ja sanoo tri Brackmanille: "Ne ovat tulossa", ja sen jälkeen "Päätavoite saavutettu". Aeonien lopussa näkyy vain prinsessa, joka avaa silmänsä ja sanoo: "...Ei!". UEF:n lopussa näytetään tutkan täyttyvän tunnistamattomista kohteista lähellä Black Sunia. Kaikki loput viittaavat lisäosa Forged Allianceen ja näyttävät Seraphimien paluun.