Kingdom Hearts: 358/2 Days

Tarina alkaa Twilight Townissa, josta Xemnas, Organisaatio XIII:n johtaja, löytää Roxasin ja tekee tästä Organisaation jäsenen XIII. Roxas on erilainen kuin muut, koska hänellä ei ole todellisen minänsä, Soran, muistoja. Hänet lähetetään tuhoamaan sydämettömiä, jotta Organisaatio voisi luoda niistä omat versionsa Kingdom Heartsista. Roxasin opastajana toimii jäsen VIII, Axel, josta tulee Roxasin läheinen ystävä. Kun Axel lähtee jäsenen XI, Marluxian, ja muutaman muun mukana Unohduksen linnaan (Castle Oblivion), Roxasin uudeksi pariksi määrätään Xion, Organisaation jäsen XIV. Roxas ja Xion osasivat kumpikin käyttää keybladeä. Samaan aikaan Organisaatioon kuulumaton ei-kukaan, Naminé, muuntelee Soran muistoja. Tämä vaivuttaa Roxasin koomaan. Roxas herää vasta viikkojen kuluttua, jolloin Axel oli ainut Unohduksen linnasta elossa palannut.

Xionista tulee läheinen ystävä Roxasille ja Axelille. Mutta kohdattuaan eräänä päivänä Rikun, Xion päättää ottaa selvää itsestään. Hän huomaa olevansa pelkkä Xemnasin luoma replika, joka vastoin hänen odotuksiaan kantoikin mukanaan osaa Soran muistoista. Hän päättää paeta. Axel yrittää estää Roxasia löytämästä häntä ja tämän seurauksena Roxas hylkää Organisaation.

Xemnasin manipuloima Xion hyökkää Roxasin kimppuun. Xion häviää taistelun ja yhdistyy osaksi Roxasia pyytäen tätä pysäyttämään Organisaation aikeet. Kun Roxas palaa Maailmaan jota ei koskaan ollut (the World That Never Was), Riku hyökkää hänen kimppuunsa. Riku on vähällä hävitä mutta vapauttaa pimeyden sisältään ja muuttuu sydäntään hallinneen ”Ansemin” näköiseksi. Riku vie Roxasin DiZille, joka pyyhkii Roxasin muistot ja lähettää tämän virtuaaliseen versioon Twilight Townista varmistaakseen että Roxas ennen pitkää palaa osaksi Soraa.