Far Cry 3

• Jason Brody on pelin päähenkilö, ja Grantin sekä Rileyn veli. Rikkaasta perheestä tuleva, 25-vuotias Jason pelkää tappamista, mutta joutuu puolustautumaan piraateilta samalla tottuen ajatukseen. Hän nousee lopulta Rakyat-heimon johtoon. Jason kuolee Citran tappamana tai jää eloon saarelle, kykenemättömänä palata entiseen elämäänsä.
• Grant Brody on Jasonin ja Rileyn isoveli sekä Daisyn poikaystävä. Hän on 28-vuotias ja entinen jalkaväen sotilas. Joutuessaan merirosvojen vangiksi Grant opettaa Jasonille lähitaistelua ja auttaa tätä pakenemaan, kunnes Vaas ampuu tätä kaulaan. Grant on ainoa hahmo Jasonin ryhmästä, joka kuolee pelaajan päätöksistä huolimatta.
• Riley Brody on 21-vuotias, Brodyn veljesten nuorimmainen. Alussa Rileyn uskotaan kuolleen, mutta myöhemmin paljastuu että hän on Hoytin vankina. Jason joutuu kiduttamaan tätä Hoytin käskystä. Hän kuolee, mikäli Jason päättää tappaa ystävänsä.
• Liza Snow on Jasonin 24-vuotias tyttöystävä, joka yrittää estää Jasonia ajautumasta hankaluuksiin saarella. Pari eroaa Jasonin päästessä väkivallan ja uuden elämän makuun. Hän kuolee, mikäli Jason päättää tappaa ystävänsä.
• Daisy Lee on Grantin 26-vuotias tyttöystävä ja etevä mekaanikko, Pelastauduttuaan hän rupeaa korjaamaan kaverusten pakoveneen. Hän kuolee, mikäli Jason päättää tappaa ystävänsä.
• Oliver Carswell on 23-vuotias, Brodyn veljesten ystävän. Hän kuolee, mikäli Jason päättää tappaa ystävänsä.
• Keith Ramsay on 24-vuotias, Brodyn veljesten ystävä. Joutuu mahdollisesti palkkamurhaaja Buckin raiskaamaksi ja pyytää Jasonia olemaan puhumatta aiheesta muille. Hän kuolee, mikäli Jason päättää tappaa ystävänsä.
• Alec Earnhardt on 65-vuotias, piraateille työskentelevä huumekauppias. Hän on kuitenkin Jasonin sekä tämän ystävien puolella. Hän pelastaa Daisyn ja auttaa Jasonia. Hän on hurahtanut vahvasti saarelta löytyviin huumeisiin. Hän kuolee Rakyatin tappamana puolustaessaan Jasonin ystäviä.
• Vaas Montenegro on 27-vuotias merirosvojoukon johtaja ja Hoytin korkea-arvoisin alamainen. Hän oli alun perin Rakyatin jäsen, kunnes erosi siitä saadessaan heimon parhaimman soturin tittelin. Psykopaattinen Vaas yrittää useasti tappaa Jasonin, mutta kuolee Jasonin tappamana. Hän on hyvin suosittu hahmo Far Cry-fanien keskuudessa.
• Hoyt Volker on 45-vuotias saaren orjakauppias sekä huume- ja asemyynnin johtaja. Hän on erittäin sadistinen eikä halua kenenkään astuvan hänen varpailleen. Hän kuolee Jasonin tappamana.
• Bambi "Buck" Hughes on 43-vuotias ja eräs saaren vaarallisimmista miehistä, joka käyttää Keithiä hyväkseen. Hän kuolee Jasonin tappamana.
• Dennis Rogers on 37-vuotias Rakyat-heimon jäsen, joka auttaa Jasonia tämän paettua merirosvojen vankileiriltä.
• Citra Talugmai on 29-vuotias papitar, joka johtaa Rakyat-heimoa ja taistelee Vaas-veljensä johtamia merirosvoja vastaan. Hän rakastuu Jasoniin ja toivoo tämän jäävän kanssaan saarelle. Hän kuolee Dennisin tappamana, mikäli Jason valitsee ystävänsä saaren sijaan.
• Willis Huntley on 47-vuotias agentti ja vannoutunut patriootti, joka kuljettaa Jasonin Hoytin saarelle pienoislentokoneellaan.
• Samuel "Sam" Becker on 45-vuotias, saksalainen sotilas joka on kaksoisagentti Hoytin alaisena. Hän auttaa Jasonia soluttautumaan Hoytin joukkoihin ja joutuu lopulta Hoytin puukottamaksi.
• Hurk Drubman Jr. on 40-vuotias, apinoihin pommeja kiinnittävä ja hieman yksinkertainen jenkki.

Jason Brody ja hänen veljensä Grant ja Riley sekä Jasonin tyttöystävä Liza, Grantin tyttöystävä Daisy ja porukan ystävät Keith ja Oliver ovat lomalla Bangkokissa. He hyppäävät laskuvarjolla Rook-saaristoon, jossa he joutuvat merirosvojen kaappaamiksi. Heidän johtaja Vaas tappaa Grantin, mutta antaa Jasonille mahdollisuuden paeta. Viidakosta Jasonin löytää Dennis Rogers, joka kertoo merirosvoja vastaan taistelevasta Rakyat-heimosta. Dennis kokee Jasonin olevan lupaava soturi ja esittelee tämän Citralle, heimon johtajalle, joka antaa Jasonille soturin tatuoinnit. Jason etsii ystäviään ja taistelee Rakyatin puolesta merirosvojen sortoa vastaan.

Vähitellen aluksi pelokkaasta Jasonista kypsyy pelottava soturi, jota kunnioitetaan Rakyatissa. Hänen entiset ystävänsä alkavat kuitenkin nähdä Jasonin vaarallisena. Jason pohtii asettuvansa saarelle. Hän onnistuu tappamaan Vaasin ja alkaa jahdata tämän työnantajaa, Hoyt Volkeria, joka johtaa orja - ja huumekauppaa. Jason vannoo Citralle tappavansa Hoytin kaiken sen jälkeen, mitä tämä on tehnyt saaren asukkaille. Jason soluttautuu vihollisten leiriin ja hankkii uuden identiteetin vihollissotilaalta, Fosterilta. Jason saa tietää, että hänen kuolleeksi luultu veljensä Riley on elossa. Suorittaessaan peiteoperaatiota Jason joutuu pahoinpitelemään veljensä, samalla kyseenalaistaen itsensä.

Vaikka peiteoperaatio paljastuu, Jason tappaa Hoytin ja onnistuu pelastamaan kaikki ystävänsä, mutta nämä joutuvat Citran vangeiksi. Paljastuu, että Citra on rakastunut Jasoniin ja uskoo tämän olevan Rakyatin mystisen soturin jälkeläinen. Citra huumaa Jasonin, ja palatessaan tajuihinsa tämä huomaa pitävänsä veistä Lizan kaulalla. Pelaaja saa valittavakseen joko pelastaa ystävänsä tai tappaa heidät.

Pelasta ystävät: Jason vapauttaa kahlitut ystävänsä ja toteaa, että verta on vuotanut tarpeeksi. Citra pyytää Jasonia jäämään, ja raivostunut Dennis kokee Jasonin olevan kiittämätön. Dennis yrittää puukottaa Jasonia, mutta Citra siirtyy hänen eteensä ja puukko iskeytyykin tämän vatsaan. Ennen kuolemaansa Citra pyytää anteeksi ja kertoo Jasonille rakastavansa tätä. Dennis pitelee Citran ruumista käsissään, katuen tekoaan. Jasonin ystävät lähtevät saarelta, mutta Jason toteaa olevansa kykenemätön palaamaan normaaliin elämään kaiken sen jälkeen, mitä hän on tehnyt. Jason jää saarelle, ja kertoo tuntevansa vihan sisällään ja sanoo tulleensa hirviöksi.

Liity Citraan: Jason tappaa ystävänsä ja siittää Citran. Lopulta Citra tappaa Jasonin ja kertoo, että heidän lapsensa tulee johtamaan heimoa, ja että Jason kuolee soturina.