Bacteroides fragilis
Bacteroides fragilis on gramnegatiivinen, obligaattinen anaerobi sauvanmuotoinen bakteeri, joka on osa ihmisen ruoansulatuselimistön normaaliflooraa.[1], Se on kuitenkin verraten harvalukuinen ihmisen elimistössä ja muodostaa vain 0,5 % ihmisen suoliston mikrobiomista.[2] Vaikka B.fragilis on kommensaali, se voi tietyissä olosuhteissa aiheuttaa erilaisia infektioita ja sairauksia.
Taksonomia, rakenne ja genomi
B. fragilis on Bacteroidaceae-heimoon kuuluvan Bacteroides-suvun jäsen. Se ekspressoi soluseinällään sfingolipidejä ja diaminopimeliinihappoja. Sen genomi on kooltaan noin 5,2 miljoonaa emäsparia, joista noin 90 % koodaa proteiineja.[3]
Patogeneesi ja hoito
Vaikka normaalisti bakteeri ei aiheuta tauteja, sillä on myös patogeenisia ominaisuuksia, ja sitä voidaankin pitää opportunistisena patogeenina. Vaikka sitä on normaalifloorassa normaalisti melko pieni osuus, se on yksi tyypillisimpiä anaerobisia bakteereja, jotka aiheuttavat tulehduksia tai bakteremiaa elimistössä esimerkiksi leikkausten tai haavaumien yhteydessä tai tulehduksiin jotka ovat yhdistettävissä suolistoon.[4] Lisäksi tietyt kannat on yhdistetty suolistosyöpien kehittymiseen,[5] sekä pitkäaikaisiin suolistollisiin tulehdussairauksiin.[6] B. fragilis voi aiheuttaa myös ripulia.[7]
B. fragiliksen aiheuttamaa tulehdusta voidaan hoitaa metronidatsolilla ja karbapeneemeilla.[8]
Lähteet
Wexler H. M. (2007). Bacteroides: the good, the bad, and the nitty-gritty. Clinical microbiology reviews, 20(4), 593–621. https://doi.org/10.1128/CMR.00008-07
Genomic analysis of Bacteroides fragilis reveals extensive DNA inversions regulating cell surface adaptation Tomomi Kuwahara, Atsushi Yamashita, Hideki Hirakawa, Haruyuki Nakayama, Hidehiro Toh, Natsumi Okada, Satoru Kuhara, Masahira Hattori, Tetsuya Hayashi, Yoshinari Ohnishi Proceedings of the National Academy of Sciences Oct 2004, 101 (41) 14919-14924; DOI: 10.1073/pnas.0404172101
David R. Snydman, Nilda V. Jacobus, Laura A. McDermott, Yoav Golan, David W. Hecht, Ellie J. C. Goldstein, Lizzie Harrell, Stephen Jenkins, Duane Newton, Carl Pierson, John D. Rihs, Victor L. Yu, Richard Venezia, Sydney M. Finegold, Jon E. Rosenblatt, Sherwood L. Gorbach, Lessons Learned from the Anaerobe Survey: Historical Perspective and Review of the Most Recent Data (2005–2007), Clinical Infectious Diseases, Volume 50, Issue Supplement_1, February 2010, Pages S26–S33, https://doi.org/10.1086/647940
Bao, Y., Tang, J., Qian, Y. et al. Long noncoding RNA BFAL1 mediates enterotoxigenic Bacteroides fragilis-related carcinogenesis in colorectal cancer via the RHEB/mTOR pathway. Cell Death Dis 10, 675 (2019). https://doi.org/10.1038/s41419-019-1925-2
Viitteet
- Madigan, Michael T.; Bender, Kelly S.; Buckley, Daniel H. et al.: Brock Biology of Microorganisms (Global Edition). Pearson, 2019. ISBN 978-129-223-510-3. (englanniksi)
- Wexler, H. M.: Bacteroides: the Good, the Bad, and the Nitty-Gritty. Clin Microbiol Rev., Lokakuu 2007, 20. vsk, nro 4, s. 593–621. American Society for Microbiology (ASM). DOI 10.1128/CMR.00008-07. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 25.3.2021.
- Kuwahara, T.; Yamashita, A.; Hirakawa, H. et al.: Genomic analysis of Bacteroides fragilis reveals extensive DNA inversions regulating cell surface adaptation. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS), Lokakuu 2004, 101. vsk, nro 41, s. 14919-14924. National Academy of Sciences (NAS). ISSN 1091-6490. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 26.3.2021. (englanniksi)
- Snydman, D. R.; Jacobus, N. V.; McDermott, L. A. et al.: Lessons Learned from the Anaerobe Survey: Historical Perspective and Review of the Most Recent Data (2005–2007). Clinical Infectious Diseases, Helmikuu 2010, 50. vsk, nro Supplement 1, s. S26–S33. Oxford University Press. ISSN 1537-6591. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 25.3.2021. (englanniksi)
- Bao, Y.; Tang, J.; Qian, Y. et al.: Long noncoding RNA BFAL1 mediates enterotoxigenic Bacteroides fragilis-related carcinogenesis in colorectal cancer via the RHEB/mTOR pathway. (Nature-lehti) Cell Death & Disease, Syyskuu 2019, 10. vsk, nro 675. Springer Nature. ISSN 1476-4687. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 25.3.2021. (englanniksi)
- Prindiville, T. P.; Sheikh, R. A.; Cohen, S. H. et al.: Bacteroides fragilis enterotoxin gene sequences in patients with inflammatory bowel disease. Emerg Infect Dis., Maalis-huhtikuu 2000, 6. vsk, nro 2, s. 171–174. Centers for Disease Control and Prevention. ISSN 1080-6059. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 25.3.2021. (englanniksi)
- Sears, C. L.; Geis, A. L. & Housseau F.: Bacteroides fragilis subverts mucosal biology: from symbiont to colon carcinogenesis. J Clin Invest., Lokakuu 2014, 124. vsk, nro 10, s. 4166–4172. American Society for Clinical Investigation (ASCI). ISSN 1558-8238. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 25.3.2021. (englanniksi)
- Jamal, W.; Khodakhast, F. B.; AlAzmi, A. et al.: Prevalence and antimicrobial susceptibility of enterotoxigenic extra-intestinal Bacteroides fragilis among 13-year collection of isolates in Kuwait. BMC Microbiology, Tammikuu 2020, 20. vsk, nro 14. BioMed Central (BMC). ISSN 1471-2180. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 25.3.2021. (englanniksi)