Tevenvirinae

Die Tevenvirinae sind eine Unterfamilie von Viren in der Familie Straboviridae der Klasse Caudoviricetes, Morphotyp Myoviren. Als natürliche Wirte dienen Bakterien und Archaeen. Es gibt derzeit etwa 147 Arten (Spezies) in dieser Unterfamilie, die meisten davon sind einer von 14 Gattungen zugewiesen (Stand 5. November 2023).[3][4] Die Unterfamilie Tevenvirinae ist zu unterscheiden von der früheren englischen Bezeichnung T-even bacteriophages für die in ihr enthaltene Spezies Tequatrovirus T4 mit den Stämmen T2, T4, T6, ….

Tevenvirinae

EM-Aufnahme zweier Virionen
der Gattung Tequatrovirus

Systematik

Klassifikation:	Viren
Realm:	Duplodnaviria[1]
Reich:	Heunggongvirae[1]
Phylum:	Uroviricota[1]
Klasse:	Caudoviricetes[2]
Ordnung:	incertae sedis
Familie:	Straboviridae
Unterfamilie:	Tevenvirinae

Taxonomische Merkmale

Genom:	dsDNA linear
Baltimore:	Gruppe 1
Symmetrie:	ikosaedrisch, tailed (Myoviren)
Hülle:	keine

Wissenschaftlicher Name

Tevenvirinae

Links

NCBI Taxonomy:	1198136
ViralZone (Expasy, SIB):	2796
ICTV Taxon History:	201900278

Aufbau

Die Viruspartikel (Virionen) der Tevenvirinae sind nicht eingehüllt und haben den für Mitglieder der Klasse Caudoviricetes typische Kopf-Schwanz-Aufbau. Der länglich-ikosaedrische Kopf ist etwa 70 nm breit und 140 nm lang. Das dsDNA-Genom ist linear und hat eine Länge von etwa 170–245 kbp (Kilobasenpaaren). Es kodiert etwa 300 bis 415 Proteine.[4]

Schemazeichnungen eines Virusteilchens der Spezies Tequatrovirus T4 (Querschnitte und Seitenansicht)

Vermehrungszyklus

Die Virusreplikation geschieht im Zytoplasma der Wirtszelle (dem Bakterium bzw. Archaeon). Der Eintritt in die Wirtszelle geschieht durch Adsorption. Das Virus tritt durch Lyse (Auflösung der Wirtszelle, d. h. ihrer Außenmembran) aus der Wirtszelle aus. Die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.[4]

Systematik

Die folgende Liste führt die Gattungen und (auszugsweise) Spezies und Stämme in der Unterfamilie Tevenvirinae auf (mit Stand 4. November 2023 gemäß der International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) Master Species List (MSL) #38 März/April 2023.[3][5]

Klasse: Caudoviricetes, Morphotyp: Myoviren; Familie: Straboviridae

Unterfamilie: Tevenvirinae
- Gattung: Dhakavirus (früher Js98virus, 12 Spezies)
  - Spezies: Escherichia-Virus Bp7 (wiss. Dhakavirus bp7)
  - Spezies: Escherichia-Virus IME08 (wiss. Dhakavirus ime08)
  - Spezies: Escherichia-Virus JS10 (wiss. Dhakavirus JS10)
  - Spezies: Escherichia-Virus JS98 (wiss. Dhakavirus JS98)
  - Spezies: Escherichia-Virus QL01 (wiss. Dhakavirus ql01)
  - Spezies: Escherichia-Virus VR5 (wiss. Dhakavirus vr5)
  - Spezies: Escherichia-Virus WG01 (wiss. Dhakavirus wg01)
  - Spezies: Dhakavirus ime281
  - Spezies: Dhakavirus ime348
  - Spezies: Dhakavirus JS98
  - Spezies: Dhakavirus mx01
- Gattung: Gaprivervirus (früher Sp18virus, 6 Spezies)
  - Spezies: Escherichia-Virus VR7 (wiss. Gaprivervirus vr7)
  - Spezies: Escherichia-Virus VR20 (wiss. Gaprivervirus vr20)
  - Spezies: Escherichia-Virus VR25 (wiss. Gaprivervirus vr25)
  - Spezies: Escherichia-Virus VR26 (wiss. Gaprivervirus vr26)
  - Spezies: Shigella-Virus SP18 (wiss. Gaprivervirus sp18)
  - Spezies: Gaprivervirus arezed
- Gattung: Gelderlandvirus (früher S16virus, 5 Spezies)
  - Spezies: Salmonella-Virus Melville (wiss. Gelderlandvirus melville)
  - Spezies: Salmonella-Virus S16 (wiss. Gelderlandvirus s16)
  - Spezies: Salmonella-Virus STML198 (wiss. Gelderlandvirus stml198)
  - Spezies: Salmonella-Virus STP4a (wiss. Gelderlandvirus stp4a)
- Gattung: Jiaodavirus (früher Jd18virus, 6 Spezies)
  - Spezies: Klebsiella-Virus JD18 (wiss. Jiaodavirus jd18)
  - Spezies: Klebsiella-Virus PKO111 (wiss. Jiaodavirus pko111)
- Gattung: Kagamiyamavirus (1 Spezies)
  - Spezies: Kagamiyamavirus ecs1
- Gattung: Kanagawavirus (5 Spezies)
  - Species Kanagawavirus eclm
  - Spezies Kanagawavirus mime
  - Spezies Kanagawavirus threeohfive
- Gattung: Karamvirus (früher Cc31virus, 4 Spezies)
  - Spezies: Enterobacter-Virus PG7 (wiss. Karamvirus pg7)
  - Spezies: Enterobacter-Virus CC31 (syn. Escherichia-Virus CC31, wiss. Karamvirus cc31)
- Gattung: Moonvirus (4 Spezies)
  - Spezies: Citrobacter-Virus CF1 (wiss. Moonvirus cf1)
  - Spezies: Moonvirus kayemsixteen, mit
    - Salmonella-Phage KM16
  - Spezies: Citrobacter-Virus Merlin (wiss. Moonvirus merlin)
  - Spezies: Citrobacter-Virus Moon (wiss. Moonvirus moon)
- Gattung: Mosigvirus (früher Rb69virus, 13 Spezies)
  - Spezies: Escherichia-Virus APCEc01 (wiss. Mosigvirus mar005p1)
  - Spezies: Escherichia-Virus HX01 (wiss. Mosigvirus HX01)
  - Spezies: Escherichia-Virus JS09 (mit Schreibvariante Escherichia-Virus vB_EcoM_JS09 und Synonam Escherichia-Virus ST0,[6] wiss. Mosigvirus JS09), mit
    - Escherichia phage ST0
    - Escherichia-Phage vB_EcoM-pEK20
    - Escherichia-Phage vB_EcoM_JS09 (alias Escherichia-Phage YZ-2013)
    - Escherichia-Phage vB_EcoM_LNA2
    - Escherichia-Phage vB_EcoM_TU01
    - Escherichia phage vB_EcoM-ZQ3
    - Shigella-Phage SSE1
  - Spezies: Escherichia-Virus O157tp3 (synonym Escherichia-Virus O157tp6,[6] wiss. Mosigvirus 0157tp3), mit
    - Escherichia coli O157 typing phage 3
    - Escherichia coli O157 typing phage 6
    - Escherichia coli O157 typing phage 13
  - Spezies: Escherichia-Virus PhAPEC2 (wiss. Mosigvirus phapec2)
  - Spezies: Escherichia-Virus RB69 (wiss. Mosigvirus RB69)
  - Spezies: Shigella-Virus SHSML521 (wiss. Mosigvirus shsm521)
  - Spezies: Shigella-Virus UTAM (wiss. Mosigvirus utam)
  - Spezies: Mosigvirus 25307
  - Spezies: Mosigvirus atk47
  - Spezies: Mosigvirus c120
  - Spezies: Mosigvirus HX01
  - Spezies: Mosigvirus p000v
  - Spezies: Mosigvirus sf
- Gattung: Mosugukvirus (1 Spezies)
  - Spezies: Mosugukvirus pm2, mit
    - Pectobacterium-Bakteriophage PM2 (engl. Pectobacterium bacteriophage PM2)[A. 1]
- Gattung: Roskildevirus (1 Spezies)
  - Spezies Roskildevirus cronus, mit
    - Erwinia-Phage Cronus
- Gattung: Tegunavirus (früher Tg1virus, 3 Spezies)
  - Spezies Tegunavirus fheyen901, mit
    - Yersinia-Phage fHe-Yen9-01
  - Spezies Yersinia-Virus R1RT (wiss. Tegunavirus r1rt)
  - Spezies Yersinia-Virus TG1 (wiss. Tegunavirus yenmtg1)
- Gattung: Tequatrovirus (früher T4virus, T4likevirus, T4-ähnliche Viren, 83 Spezies)[7]
  - Spezies: Escherichia-Virus AR1 (wiss. Tequatrovirus ar1)
  - Spezies: Escherichia-Virus C40 (wiss. Tequatrovirus c40)
  - Spezies: Escherichia-Virus CF2 (engl. Escherichia virus CF2)
  - Spezies: Escherichia-Virus E112 (wiss. Tequatrovirus e112)
  - Spezies: Escherichia-Virus ECML134 (wiss. Tequatrovirus ecml134)
  - Spezies: Escherichia-Virus HY01 (wiss. Tequatrovirus hy01)
  - Spezies: Escherichia-Virus HY03 (wiss. Tequatrovirus hy03)
  - Spezies: Escherichia-Virus Ime09 (wiss. Tequatrovirus ime09)
  - Spezies: Escherichia-Virus RB3 (wiss. Tequatrovirus RB)
  - Spezies: Escherichia-Virus RB14 (wiss. Tequatrovirus RB14)
  - Spezies: Escherichia-Virus RB32 (wiss. Tequatrovirus RB32)
  - Spezies: Escherichia-Virus slur03 (wiss. Tequatrovirus slur03)
  - EM-Aufnahme eines Virions des Enterobacteria-Phagen T4
    Spezies: Escherichia-Virus T4 (wiss. Tequatrovirus T4, ersetzt Enterobacteria phage T4 als Spezies, dies bezeichnet jetzt den Referenzstamm T4 neben T2, T6 und anderen Stämmen)
  - Spezies: Shigella-Virus Pss1 (wiss. Tequatrovirus pss1)
  - Spezies: Shigella-Virus Sf21 (wiss. Tequatrovirus sf21)
  - Spezies: Shigella-Virus Sf22 (wiss. Tequatrovirus sf22)
  - Spezies: Shigella-Virus Sf24 (wiss. Tequatrovirus sf24)
  - Spezies: Shigella-Virus SHBML501 (wiss. Tequatrovirus SHBML501)
  - Spezies: Shigella-Virus Shfl2 (wiss. Tequatrovirus shfl2)
  - Spezies: Yersinia-Virus D1 (wiss. Tequatrovirus deeone)
  - Spezies: Yersinia-Virus PST (wiss. Tequatrovirus pst)
  - Spezies: Tequatrovirus slur02 (inkl. Escherichia-Virus slur04), mit
    - Escherichia-Phage slur02
    - Escherichia-Phage slur04[8][9]
  - Spezies: Tequatrovirus slur07, mit
    - Escherichia-Phage slur07
  - Spezies Tequatrovirus yueel1 (abgetrennt von Escherichia-Virus CF2, wiss. Tequatrovirus cf2), mit
    - Escherichia-Phage YUEEL01
    - Escherichia-Phage HP3 (früher zu Escherichia-Virus HP3, wiss. Mosigvirus hp3)[10][11]
- Gattung: Winklervirus (mit Schreibvariante Winklevirus,[6] 2 Spezies)
  - Spezies Serratia-Virus CHI14 (wiss. Winklervirus chi14)
  - Spezies Winklervirus xtwenty, mit
    - Serratia-Phage X20
  - Spezies: „Serratia-Phage vB_SspM_LC53“ (engl. „Serratia phage vB_SspM_LC53“)
- ohne Gattungszuweisung (1 Spezies)
  - Spezies: Acinetobacter-Virus 133 (engl. Acinetobacter virus 133)
  - Spezies: „Pseudomonas-Virus 42“ (engl. Pseudomonas virus 42),[A. 2] mit
    - Pseudomonas-Phage 42
  - Spezies „Escherichia-Phage phiEC1“ (engl. „Escherichia phage phiEC1“), inkl.[13]
    - Escherichia-Phage vB_EcoM_SA35RD
    - Escherichia-Phage vB_EcoM_SA79RD

Anmerkungen

Pectobacterium-Bakteriophage PM2 ist zu unterscheiden von anderen Phagen mit der Bezeichnung „PM2“, etwa Pseudoalteromonas-Phage PM2 (Spezies Corticovirus PM2, Corticoviridae).
vom ICTV ausgelistet mangels Genom-Sequenz[12]

Weblinks

Einzelnachweise

ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35).
ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
ICTV: Taxonomy Browser.
Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 27. Dezember 2018 (englisch).
Andrew M. Kropinski et al.: To amend the membership of the genus T4likevirus, and create six (6) new genera in the subfamily Tevenvirinae, on: ICTV Online
Andrew Millard, Richard Puxty, Dan White, Lucy Gannon, Christian Harrison, Ryan Cook, Evelien M. Adriaenssens, Dann Turner: Create two new families (Kyanoviridae and Straboviridae) (Caudoviricetes). Vorschlag 2021.082B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
SIB: Tequatrovirus syn. T4virus und T4likevirus.
ICTV: Taxon Details: Species: Escherichia virus slur04.
Zitat: „Escherichia phage slur04 was identical to slur02, so this species was abolished and slur02 retained.“ Dann Turner, ICTV am 7. November 2023 (Persönliche Mitteilung an ErnstS).
ICTV: Taxon Details: Species: Mosigvirus hp3.
Zitat: „Escherichia phage HP3 (KY608967) does not fall within the genus Mosigvirus, it is a strain of YUEEL01 (KY290975.3), a Tequatrovirus species.“ Dann Turner, ICTV am 7. November 2023 (Persönliche Mitteilung an ErnstS).
ICTV: Taxon Details: Species: Pseudomonas virus 42. Dazu:
- Susan M. Lehman, Evelien M. Adriaenssens: Abolish species Pseudomonas virus 42 (Caudovirales: Myoviridae). Vorschlag 2020.003B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
Zitat: „Escherichia phages vB_EcoM_SA35RD and vB_EcoM_SA79RD are strains of Escherichia phage phiEC1 and so will not appear in the VMR or MSL.“ Dann Turner, ICTV am 7. November 2023 (Persönliche Mitteilung an ErnstS).

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[7] Pectobacterium-Bakteriophage PM2 ist zu unterscheiden von anderen Phagen mit der Bezeichnung „PM2“, etwa Pseudoalteromonas-Phage PM2 (Spezies Corticovirus PM2, Corticoviridae).

[ausgelistet-14] vom ICTV ausgelistet mangels Genom-Sequenz[12]

[ICTV_MSL#35_T4-1] ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterobacteria phage T4, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35).

[ICTV_MSL#37v2-2] ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.

[ICTV-Browser-3] ICTV: Taxonomy Browser.

[ViralZone-4] Viral Zone. ExPASy, abgerufen am 27. Dezember 2018 (englisch).

[5] Andrew M. Kropinski et al.: To amend the membership of the genus T4likevirus, and create six (6) new genera in the subfamily Tevenvirinae, on: ICTV Online

[Proposal-6] Andrew Millard, Richard Puxty, Dan White, Lucy Gannon, Christian Harrison, Ryan Cook, Evelien M. Adriaenssens, Dann Turner: Create two new families (Kyanoviridae and Straboviridae) (Caudoviricetes). Vorschlag 2021.082B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).

[8] SIB: Tequatrovirus syn. T4virus und T4likevirus.

[ICTV_slur04-9] ICTV: Taxon Details: Species: Escherichia virus slur04.

[10] Zitat: „Escherichia phage slur04 was identical to slur02, so this species was abolished and slur02 retained.“ Dann Turner, ICTV am 7. November 2023 (Persönliche Mitteilung an ErnstS).

[ICTV_hp3-11] ICTV: Taxon Details: Species: Mosigvirus hp3.

[12] Zitat: „Escherichia phage HP3 (KY608967) does not fall within the genus Mosigvirus, it is a strain of YUEEL01 (KY290975.3), a Tequatrovirus species.“ Dann Turner, ICTV am 7. November 2023 (Persönliche Mitteilung an ErnstS).

[ICTV_PsV42-13] ICTV: Taxon Details: Species: Pseudomonas virus 42. Dazu:
Susan M. Lehman, Evelien M. Adriaenssens: Abolish species Pseudomonas virus 42 (Caudovirales: Myoviridae). Vorschlag 2020.003B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).

[15] Susan M. Lehman, Evelien M. Adriaenssens: Abolish species Pseudomonas virus 42 (Caudovirales: Myoviridae). Vorschlag 2020.003B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).

[15] Zitat: „Escherichia phages vB_EcoM_SA35RD and vB_EcoM_SA79RD are strains of Escherichia phage phiEC1 and so will not appear in the VMR or MSL.“ Dann Turner, ICTV am 7. November 2023 (Persönliche Mitteilung an ErnstS).