Lymphocystivirus

Lymphocystivirus (LCDV, auch LCV) ist eine Gattung von Riesenviren (Nucleocytoviricota, NCLDVs) aus der Familie der Iridoviridae, Unterfamilie Alphairidovirinae.[2] Die natürlichen Wirte der Lymphocystiviren sind Fische, und zwar wie auch die beiden anderen Gattungen Megalocytivirus und Ranavirus der Unterfamilie Alphairidovirinae Echte Knochenfische (Teleostei), bei denen sie tumorähnliche Hautwucherungen verursachen.[2][3][4]

Lymphocystivirus
Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Varidnaviria[1]
Reich: Bamfordvirae[1]
Phylum: Nucleocytoviricota[1]
Klasse: Megaviricetes[1]
Ordnung: Pimascovirales[1]
Familie: Iridoviridae
Unterfamilie: Alphairidovirinae
Gattung: Lymphocystivirus
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Lymphocystivirus
Links
NCBI Taxonomy: 10494
ViralZone (Expasy, SIB): 583
ICTV Taxon History: 201903727

Die Typusspezies ist Lymphocystis disease virus 1 (LCDV-1).[2]

Wirte

Die Typusspezies LCDV-1 (auch LCV-1) infiziert die (Europäische) Flunder (Platichthys flesus) und die (Europäische) Scholle (auch Goldbutt, Pleuronectes platessa). LCV-2 infiziert die Kliesche (auch Eisflunder, Limanda limanda).[5] Lymphocystis-Virus C (LCDV-C)[6] infiziert offenbar die Japanische Flunder (englisch olive flounder, Paralichthys olivaceous).[7]

Lymphocystiviren infizieren insgesamt weltweit mehr als 140 Süßwasser- und Meeresspezies[5] aus mindestens 42 Familien[8] und verursachen die chronische Krankheit Lymphocystis. Zwar haben Lymphozystiviren bisher im Gegensatz zu Megalozytiviren und Ranaviren keine Massensterben verursacht. An Lymphocystis erkrankte Fische weisen deutlich sichtbare papillomähnliche Hautläsionen auf, die ihren kommerziellen Wert erheblich verringern.[7][9] Mit Stand 2006 waren keine Impfstoffe gegen Lymphocystis-Viren erhältlich.[7]

Aufbau

Die Viruspartikel (Virionen) der Gattung Lymphocystivirus sind behüllt und haben ikosaedrische und polyedrische Geometrie mit T=189–217-Symmetrie. Ihr Durchmesser liegt bei 120–350 nm.

Genom

Das Genom ist unsegmentiert, linear und besteht aus doppelsträngiger DNA (dsDNA). Die Länge beträgt ungefähr 100 kb.[2][3]

Das Genom der Typusspezies LCV-1 hat eine Länge von mindestens 102,7 kbp und 195 potenziellen offenen Leserahmen (englisch open reading frames, ORFs) und kodiert unter anderem für zwei DNA-abhängige RNA-Polymerase-Untereinheiten, eine DNA-Methyltransferase, eine DNA-Polymerase, eine Guanosintriphosphatphosphohydrolase (GTPase), eine Helikase, Proteinkinasen, eine Ribonukleosiddiphosphatreduktase und Zinkfingerproteine.[10][11]

Das Genom einer weiteren Spezies, LCV-2, ähnelt dem von LCV-1, ist jedoch mit einer Länge von etwa 98 kbp etwas kleiner.[12]

Vermehrungszyklus

Lymphocystiviren lagern sich an die Wirtszelle an und treten durch eine Rezeptor-vermittelte Endocytose ein, ähnlich wie bei anderen Mitgliedern der Iridoviridae[13] Die eingedrungenen Viruspartikel sind unbeschichtet und bewegen sich zum Zellkern, wo die DNA-Replikation über eine viruskodierte DNA-Polymerase beginnt.[14] Die virale DNA wandert dann in das Zytoplasma, wo eine zweite Stufe der DNA-Replikation stattfindet, bei der DNA-Concatemere gebildet werden.[14] Die konkatamerische Virus-DNA wird anschließend in Virionen verpackt.[15] Das Genom von Ranavirus weist wie bei anderen Iridoviridae terminal redundante DNA auf.[14] Die Transkription ist DNA-gestützt.[2][3]

Systematik

Die innere Systematik der Gattung Lymphocystivirus ist noch in der Diskussion, ICTV und NCBI differieren etwas. Die Systematik mit Stand April 2021 nach ICTV (inkl. einiger Vorschläge nach NCBI in doppeltan Anführungszeichen) ist wie folgt:[2][5]

  • Unterfamilie Alphairidovirinae
  • Gattung: Lymphocystivirus
  • Spezies: Lymphocystis disease virus 1 (alias Fish lymphocystis disease virus, LCDV-1, LCV-1, LDV-1, FLCDV, FLDV, Typusspezies)[16]
  • Spezies: Lymphocystis disease virus 2 (LCV-2, LCDV-2)
  • Dab lymphocystis disease virus
  • Spezies: Lymphocystis disease virus 3 (LCV-3, LCDV-3)
  • Spezies: „Lymphocystis disease virus 4“ (LCDV-4)
  • Spezies „Lymphocystis disease virus-China“ (alias „Lymphocystis disease virus - isolate China“, LCDV-C)[6][7]
  • Spezies „Lymphocystis disease virus Sa“ (LCDV-Sa)[6]


Einzelnachweise
  1. ICTV: ICTV Taxonomy history: Frog virus 3, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  2. ICTV: Iridoviridae. In: ICTV Online (10th) Report. (englisch).
  3. Viral Zone: Lymphocystivirus. ExPASy, abgerufen am 23. Juli 2019.
  4. RJ Whittington, JA Becker, MM Dennis: Iridovirus infections in finfish - critical review with emphasis on ranaviruses. In: Journal of Fish Diseases. 33. Jahrgang, Nr. 2, 2010, S. 95–122, doi:10.1111/j.1365-2761.2009.01110.x, PMID 20050967.
  5. S Essbauer, W Ahne: Viruses of Lower Vertebrates. In: Journal of Veterinary Medicine B, Infectious Diseases and Veterinary Public Health. 48. Jahrgang, Nr. 6, 2001, S. 403–475, doi:10.1046/j.1439-0450.2001.00473.x, PMID 11550762.
  6. Maya A. Halaly, Kuttichantran Subramaniam, Samantha A. Koda, Vsevolod L. Popov, David Stone, KeithWay, Thomas B. Waltzek: Characterization of a Novel Megalocytivirus Isolated from European Chub (Squalius cephalus), in: MDPI – Viruses 2019, 11, 440; doi:10.3390/v11050440, PDF
  7. I Cano, P Ferro, MC Alonso, SM Bergmann, A Romer-Oberdorfer, E Garcia-Rosado, D Castro, JJ Borrego: Development of molecular techniques for detection of lymphocystis disease virus in different marine fish species. In: Journal of Applied Microbiology. 102. Jahrgang, Nr. 1, 2006, S. 32–40, doi:10.1111/j.1365-2672.2006.03066.x, PMID 17184317.
  8. X Sheng, J Xing, W Zhan, Y Wang: Comparative studies on histopathological features of lymphocystis disease in four species of marine fish. In: Journal of Fishery Sciences of China. Nr. 5, 2007 (com.cn).
  9. M Hossain, SR Kim, MJ Oh: The lymphocystis diseases in the Olive flounder, Paralichthys olivaceous. In: University Journal of Zoology, Rajshahi University. 26, 2007, S. 59–62, doi:10.3329/ujzru.v26i0.700.
  10. CA Tidona, G Darai: The Complete DNA Sequence of Lymphocystis Disease Virus. In: Virology. 230. Jahrgang, Nr. 2, 1997, S. 207–216, doi:10.1006/viro.1997.8456, PMID 9143276.
  11. Disa Bäckström, Natalya Yutin, Steffen L. Jørgensen, Jennah Dharamshi, Felix Homa, Katarzyna Zaremba-Niedwiedzka, Anja Spang, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Thijs J. G. Ettema; Richard P. Novick (Hrsg.): Virus Genomes from Deep Sea Sediments Expand the Ocean Megavirome and Support Independent Origins of Viral Gigantism, in: mBio Vol. 10, Nr. 2, März–April 2019, S. e02497-18, PDF (Memento vom 29. Juni 2019 im Internet Archive), doi:10.1128/mBio.02497-18, PMC 6401483 (freier Volltext), PMID 30837339, ResearchGate. Nach Tabelle 2 hat das Lymphocystis disease virus (Typusspezies?) eine Genomlänge von 186.250 bp bei vorhergesagt 239 kodierten Proteinen.
  12. MHV vanRegenmortel, CM Fauquet, DHL Bishop, EB Carstens, MK Estes, SM Lemon, J Maniloff, MA Mayo, DJ McGeoch, CR Pringle, RB Wickner: Virus Taxonomy, Seventh Report of the International Committee on the Taxonomy of Viruses, in: Journal of Fish Diseases, 2000
  13. Eaton HE, Ring BA, Brunetti CR: The genomic diversity and phylogenetic relationship in the family Iridoviridae, in: Viruses, 2 (2010), S. 1458–1475, doi:10.3390/v2071458.
  14. R Goorha: Frog virus 3 DNA replication occurs in two stages. In: Journal of Virology. 43. Jahrgang, Nr. 2, 1982, S. 519–528, PMID 7109033, PMC 256155 (freier Volltext).
  15. Chinchar VG, Essbauer S, He JG, Hyatt A, Miyazaki T, Seligy V, Williams T: Family Iridoviridae, S. 145–162, in: Fauquet CM, Mayo MA, Maniloff J, Desselburger U, Ball LA (Hrsg.): Virus Taxonomy, Eighth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Academic Press, San Diego, USA 2005
  16. Yang Liu, Bich Ngoc Tran, Fan Wang, Puey Ounjai, Jinlu Wu, Choy L. Hew: Visualization of Assembly Intermediates and Budding Vacuoles of Singapore Grouper Iridovirus in Grouper Embryonic Cells, in: Sci Rep 6, 18696, 4, Januar 2016, doi:10.1038/srep18696
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