Lipidomik
Lipidomik bezeichnet in der Biochemie die Forschung zur Untersuchung von Lipiden. Die Lipidomik ist ein Teilgebiet der Metabolomik.
Klassen biogener Lipide
Eigenschaften
Bei der Lipidomik kommen unter anderem systembiologische Methoden des Hochdurchsatzes und der Bioinformatik[1] zum Einsatz, aber auch Massenspektrometrie,[2][3] NMR-Spektroskopie, Fluoreszenzspektroskopie und Duale Polarisationsinterferometrie. Die Bezeichnung wurde 2003 von X. Han und J. Gross geprägt.[4]
Die Methoden der Lipidomik beginnen meistens mit einer Extraktion der Lipide mit einer Mischung von Chloroform und Methanol nach Bligh und Dyer aus dem Jahr 1959.[5] Anschließend erfolgt oftmals eine Trennung der Lipide per Hochleistungsflüssigkeitschromatographie (HPLC).[6][7]
Literatur
- R. W. Gross: The evolution of lipidomics through space and time. In: Biochimica et Biophysica Acta. Band 1862, Nummer 8, 08 2017, S. 731–739, doi:10.1016/j.bbalip.2017.04.006, PMID 28457845, PMC 5501277 (freier Volltext).
- A. Triebl, J. Hartler, M. Trötzmüller, H. C Köfeler: Lipidomics: Prospects from a technological perspective. In: Biochimica et Biophysica Acta. Band 1862, Nummer 8, 08 2017, S. 740–746, doi:10.1016/j.bbalip.2017.03.004, PMID 28341148.
- T. A. Lydic, Y. H. Goo: Lipidomics unveils the complexity of the lipidome in metabolic diseases. In: Clinical and translational medicine. Band 7, Nummer 1, Januar 2018, S. 4, doi:10.1186/s40169-018-0182-9, PMID 29374337.
Einzelnachweise
- H. Tsugawa, K. Ikeda, M. Arita: The importance of bioinformatics for connecting data-driven lipidomics and biological insights. In: Biochimica et Biophysica Acta. Band 1862, Nummer 8, 08 2017, S. 762–765, doi:10.1016/j.bbalip.2017.05.006, PMID 28514647.
- A. D. Watson: Thematic review series: systems biology approaches to metabolic and cardiovascular disorders. Lipidomics: a global approach to lipid analysis in biological systems. In: Journal of lipid research. Band 47, Nummer 10, Oktober 2006, S. 2101–2111, doi:10.1194/jlr.R600022-JLR200, PMID 16902246.
- T. Hu, J. L. Zhang: Mass-spectrometry-based lipidomics. In: Journal of separation science. Band 41, Nummer 1, Januar 2018, S. 351–372, doi:10.1002/jssc.201700709, PMID 28859259.
- X. Han, R. W. Gross: Global analyses of cellular lipidomes directly from crude extracts of biological samples by ESI mass spectrometry: a bridge to lipidomics. In: Journal of lipid research. Band 44, Nummer 6, Juni 2003, S. 1071–1079, doi:10.1194/jlr.R300004-JLR200, PMID 12671038.
- E. G. Bligh, W. J. Dyer: A rapid method of total lipid extraction and purification. In: Canadian journal of biochemistry and physiology. Band 37, Nummer 8, August 1959, S. 911–917, doi:10.1139/o59-099, PMID 13671378.
- M. R. Wenk: The emerging field of lipidomics. In: Nature reviews. Drug discovery. Band 4, Nummer 7, Juli 2005, S. 594–610, doi:10.1038/nrd1776, PMID 16052242.
- K. Jurowski, K. Kochan, J. Walczak, M. Barańska, W. Piekoszewski, B. Buszewski: Analytical Techniques in Lipidomics: State of the Art. In: Critical reviews in analytical chemistry. Band 47, Nummer 5, September 2017, S. 418–437, doi:10.1080/10408347.2017.1310613, PMID 28340309.
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