Kyanoviridae
Kyanoviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren mit sog. Kopf-Schwanz-Aufbau (Klasse Caudoviricetes), die Cyanobakterien infizieren (solche bakteriellen Viren werden auch Bakteriophagen, genauer Cyanophagen, genannt). Die Familie wurde im März/April 2022 vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) eingerichtet.[1]
Kyanoviridae | ||||||||||||||
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EM-Aufnahmen von Virionen der Prochlorococcus-Cyanophagen P-SSM2 (Gattung Salacisavirus; oben) und P-SSM4 (Gattung Ronodorvirus; unten) | ||||||||||||||
Systematik | ||||||||||||||
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Taxonomische Merkmale | ||||||||||||||
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Wissenschaftlicher Name | ||||||||||||||
Kyanoviridae | ||||||||||||||
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Forschungsgeschichte
Diese Familie wurde vom ICTV eingerichtet, um alle T4-ähnlichen Cyanophagen zusammenzufassen. Die T4-ähnlichen Phagen, die dagegen histotrophe Bakterien[A. 1] infizieren, wurden stattdessen in der Familie Straboviridae zusammengefasst. Phylogenetische Analysen zeigen eine tiefe Verzweigung zwischen den seinerzeit neu gebildeten Familien Straboviridae und Kyanoviridae.[2]
Etymologie
Der Name der Familie Kyanoviridae leitet sich ab von ihren Wirten, den Cyanobakterien (altgriechisch κύανος kyanos, deutsch ‚blau‘, ‚cyan‘): versehen mit dem Suffix ‚-viridae‘ für Virusfamilien.[1][2]
Systematik
Innere Systematik der Familie Kyanoviridae (Stand: 5. November 2023):[1][2]
Familie Kyanoviridae (54 Gattungen)[3]
- Gattung: Acionnavirus
- Spezies Synechococcus-Vvirus SMbCM100 (wiss. Acionnavirus monteraybay), mit
- Synechococcus-Phage ACG-2014a
- Synechococcus-Phage S-MbCM100
- Spezies Synechococcus-Vvirus SMbCM100 (wiss. Acionnavirus monteraybay), mit
- Gattung: Ahtivirus
- Spezies Synechococcus-Virus SShM2 (wiss. Ahtivirus sagseatwo), mit
- Cyanophage S-RIM14
- Cyanophage S-SSM2
- Synechococcus-Phage S-ShM2
- Spezies Synechococcus-Virus SShM2 (wiss. Ahtivirus sagseatwo), mit
- Gattung: Alisovirus
- Spezies Alisovirus socal22, mit
- Synechococcus-Phage S-CAM22
- Spezies Alisovirus socal22, mit
- Gattung: Anaposvirus
- Spezies Synechococcus-Virus SCAM1 (wioss. Anaposvirus socalone), mit
- Synechococcus-Phage S-CAM1
- Spezies Synechococcus-Virus SCAM1 (wioss. Anaposvirus socalone), mit
- Gattung: Atlauavirus
- Spezies Synechococcus-Virus ACG2014f (wiss. Atlauavirus acg2014f)
- Spezies Synechococcus-Virus ACG2014fSyn7803US26 (wiss. Atlauavirus caeruleum)
- Spezies Synechococcus-Virus AC2014fSyn7803C8 (wiss. Atlauavirus tusconc8)
- Gattung: Bellamyvirus
- Spezies Synechococcus-Virus Bellamy (wiss. Bellamyvirus bellamy)
- Gattung: Bristolvirus
- Spezies Bristolvirus rhodeisland, mit
- Cyanophage S-RIM32
- Spezies Bristolvirus rhodeisland, mit
- Gattung: Brizovirus
- Spezies Prochlorococcus-Virus Syn33 (wiss. Brizovirus syn33)
- Gattung: Chalconvirus
- Gattung: Charybdisvirus
- Spezies Synechococcus-Virus SCAM3 (wiss. Charybdisvirus scam3)
- Gattung: Cymopoleiavirus
- Spezies Synechococcus-Virus SWAM2 (wiss. Cymopoleiavirus swam2)
- Gattung: Emcearvirus
- Spezies Emcearvirus gerard, mit
- Cyanophage P-RSM1
- Spezies Emcearvirus gerard, mit
- Gattung: Galenevirus
- Gattung: Gibbetvirus
- Spezies Gibbetvirus rsm4, mit
- Synechococcus-Phage S-RSM4
- Spezies Gibbetvirus rsm4, mit
- Gattung: Glaucusvirus
- Spezies Glaucusvirus ssm5, mit
- Synechococcus-Phage S-SSM5
- Spezies Glaucusvirus ssm5, mit
- Gattung: Greenvirus
- Spezies Synechococcus-Virus SSM4 (wiss. Greenvirus ssm4),[4] mit
- Synechococcus-Phage S-SSM4
- Spezies „Cyanophage S-SSM6b“
- Spezies Synechococcus-Virus SSM4 (wiss. Greenvirus ssm4),[4] mit
- Gattung: Haifavirus
- Spezies Haifavirus tim68, mit
- Prochlorococcus-Phage P-TIM68
- Spezies Haifavirus tim68, mit
- Gattung: Huanghaivirus[5]
- Spezies Huanghaivirus snothree, mit
- Synechococcus-Phage S-N03
- Spezies Huanghaivirus snothree, mit
- Gattung: Kanaloavirus
- Gattung: Leucotheavirus
- Spezies Synechococcus-Virus SP4 (wiss. Leucotheavirus sp4)
- Spezies Synechococcus-Virus Syn30 (wiss. Leucotheavirus syn30)
- Gattung: Libanvirus
- Gattung: Lipsvirus
- Spezies Lipsvirus ssm7, mit
- Synechococcus-Phage S-SSM7
- Spezies Lipsvirus ssm7, mit
- Gattung: Lowelvirus
- Gattung: Macariavirus
- Gattung: Makaravirus
- Gattung: Makelovirus
- Gattung: Mazuvirus
- Gattung: Namakavirus
- Gattung: Neptunevirus
- Spezies Synechococcus-Virus SRIM8 (wiss. Neptunevirus srim18, früher Synechococcus virus SRIM8)
- Spezies Synechococcus-Virus SRIM50 (wiss. Neptunevirus srim50, früher Synechococcus virus SRIM50)
- Gattung: Nereusvirus
- Spezies Synechococcus-Virus ACG2014bSyn7803C61 (wiss. Nereusvirus tusconc61, früher Synechococcus virus ACG2014bSyn7803C61)
- Spezies Synechococcus-Virus ACG2014bSyn9311C4 (wiss. Nereusvirus tusconc4, früher Synechococcus virus ACG2014bSyn9311C4)
- Gattung: Neritesvirus
- Gattung: Nerrivikvirus
- Spezies Nerrivikvirus srim2, mit
- Spezies Synechococcus-Virus SRIM2 (wiss. Nerrivikvirus srim2, früher Synechococcus virus SRIM2)
- Gattung: Nilusvirus
- Spezies Nilusvirus ssm2, mit
- Synechococcus-Phage S-SM2
- Spezies Nilusvirus ssm2, mit
- Gattung: Nodensvirus
- Gattung: Ormenosvirus
- Gattung: Palaemonvirus
- Spezies Prochlorococcus-Virus PSSM7 (wiss. Palaemonvirus pssm7)
- Gattung: Pontusvirus
- Gattung: Potamoivirus
- Gattung: Ronodorvirus
- Gattung: Salacisavirus
- Spezies Prochlorococcus-Virus PSSM2 (wiss. Salacisavirus pssm2, früher Myovirus P-SSM2,[14][15][16] mit
- Prochlorococcus-Phage P-SSM2 alias Cyanophage P-SSM2[7] und Phage P-SSM2 Fd – Fd wie Ferredoxin, Wirt: Prochlorococcus marinus)[17][18]
- Spezies Prochlorococcus-Virus PSSM2 (wiss. Salacisavirus pssm2, früher Myovirus P-SSM2,[14][15][16] mit
- Gattung: Scyllavirus
- Gattung: Sedonavirus
- Gattung: Serangoonvirus
- Gattung: Shandvirus
- Gattung: Shenzhenivirus
- Gattung: Sokavirus
- Gattung: Tamkungvirus
- Gattung: Tefnutvirus
- Gattung: Thaumasvirus
- Gattung: Thetisvirus (wohl zu unterscheiden von der Gattung Thetysvirus der Unterfamilie Mesomimiviridae (Mimiviridae))
- Gattung: Vellamovirus
- Spezies Synechococcus-Virus SRIM44 (wiss. Vellamovirus rhodeisland44), mit
- Cyanophage S-RIM44
- Spezies Prochlorococcus-Virus Syn1 (wiss. Vellamovirus syn1), mit
- Prochlorococcus-Phage Syn1
- Spezies Synechococcus-Virus SRIM44 (wiss. Vellamovirus rhodeisland44), mit
- Gattung: Yellowseavirus[5]
- Spezies Yellowseavirus thirtyeight, mit
- Synechococcus-Phage S-H38
- Spezies Yellowseavirus thirtyeight, mit
- Gattung: Yushanluvirus[5]
- Spezies Yushanluvirus satich, mit
- Synechococcus-Phage S-H9-2
- Spezies Yushanluvirus satich, mit
- Gattung: Zhoulongquanvirus[5]
- Spezies Zhoulongquanvirus esscess, mit
- Synechococcus-Phage S-SCSM1
- Spezies Zhoulongquanvirus esscess, mit
Wirtsspektrum
Die Wirte der Kyanoviridae sind Cyanobakterien (Blaugrünbakterien, „Blaualgen“). Dazu gehören Vertreter der Ordnungen Prochlorales[20] (Gattung Prochlorococcus) und Synechococcales[21] (Gattung Synechococcus).[A. 2][22]
Anmerkungen
- Unter histotrophen (oder histiotrophen) Bakterien werden solche verstanden, die im Gewebe (insbes. von Tieren wie den Landwirbeltieren) leben und sich dort auf üblicherweise deren Kosten (parasitisch) ernähren, vgl. Histiotrophe.
- siehe § Systematik.
Weblinks und Literatur
- Martha R. J. Clokie, Andrew D. Millard, Nicholas Harold Mann: T4 genes in the marine ecosystem: studies of the T4-like cyanophages and their role in marine ecology. In: Virology Journal, Band 7, Nr. 291, 28. Oktober 2010; doi:10.1186/1743-422X-7-291, ResearchGate (englisch).
Einzelnachweise
- ICTV: Taxon Details: Family: Kyanoviridae.
- Andrew Millard, Richard Puxty, Dan White, Lucy Gannon, Christian Harrison, Ryan Cook, Evelien M. Adriaenssens, Dann Turner: Create two new families (Kyanoviridae and Straboviridae) (Caudoviricetes). Vorschlag 2021.082B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
- ICTV: Taxonomy Browser.
- NCBI Taxonomy Browser: Greenvirus ssm4 (species).
- Andrew Millard, Richard Puxty, M. Nicholas: Creation of seven new genera within the family Kyanoviridae (Caudoviricetes) Vorschlag 2022.043B (zip:docx). Auf: ICTV (ictv.global).
- NCBI Taxonomy Browser: Synechococcus phage S-PM2 (species). NCBI
- John H. Paul, Matthew B. Sullivan: Marine phage genomics: what have we learned? In: Curr. Op. in Biotechnology, Band 16, Nr. 3, Juni 2005, S. 299–307; doi:10.1016/j.copbio.2005.03.007, PMID 15961031, PMC 15961031 (freier Volltext) (englisch); siehe insbes. Fig. 3 (Genomkarte).
- Synechococcus phage syn9 (species). NCBI
- Cyanophage Syn9 (species). NCBI
- NCBI Taxonomy Browser: Ronodorvirus ssm4 (species), equivalent: Prochlorococcus virus PSSM4.
- Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: EurekAlert! vom 26. Mai 2020, Quelle: Rice University.
- Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: ScienceDaily vom 26. Mai 2020, Quelle: Rice University.
- Ocean virus hijacks carbon-storing bacteria. Auf: National Science Foundation (NSF) vom 29. Mai 2020.
- NCBI Taxonomy Browser: Prochlorococcus virus PSSM2 (species).
- Denise Brehm: Viruses Use Bacteria for Reproduction. SciTechDaily, 26. Januar 2012
- Qinglu Zeng, Sallie W. Chisholm: Marine Viruses Exploit Their Host’s Two-Component Regulatory System in Response to Resource Limitation. In: Curr Biol, Band 22, Nr. 2, CellPress vom 24. Januar 2012, S. 124–128; doi:10.1016/j.cub.2011.11.055, PDF (englisch), Supplement 1 (PDF; 329 kB)
- Ian J. Campbell, Jose Luis Olmos Jr., Weijun Xu, Dimithree Kahanda, Joshua T. Atkinson, Othneil Noble Sparks, Mitchell D. Miller, George N. Phillips Jr., George N. Bennett, Jonathan J. Silberg: Prochlorococcus phage ferredoxin: Structural characterization and electron transfer to cyanobacterial sulfite reductases – Phage Fd characterization and host SIR interactions. In: J. Biol. Chem., ASBMB Publications, 19. Mai 2020; doi:10.1074/jbc.RA120.013501 (englisch).
- Beneath the Ocean’s Surface, a Virus Is Hijacking the Most Abundant Organism on Earth. Auf: SciTechDaily vom 6. Juni 2020, Quelle: Rice University.
- NCBI Taxonomy Browser: Synechococcus virus S-SM1 (species).
- LPSN: Order Prochlorales (ex Lewin 1977) Florenzano et al. 1986.
- LPSN: Order "Synechococcales" Hoffmann et al. 2005.
- NCBI Taxonomy Browser: Kyanoviridae, Details: Kyanoviridae (family).