Kobuvirus

Die Gattung Kobuvirus umfasst mit Stand November 2018 sechs Spezies von unbehüllten Viren aus der Familie Picornaviridae. Der Gattungsname entstammt dem japanischen Wort kobu („Knöchel“), um damit die charakteristischen Oberflächenstrukturen dieser Viren zu beschreiben.

Kobuvirus
Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[1][2]
Reich: Orthornavirae[2]
Phylum: Pisuviricota[2]
Klasse: Pisoniviricetes[2]
Ordnung: Picornavirales
Familie: Picornaviridae
Gattung: Kobuvirus
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear
Baltimore: Gruppe 4
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Kobuvirus
Links
NCBI Taxonomy: 194960
ViralZone (Expasy, SIB): 652
ICTV Taxon History: 201902014

Eigenschaften
Genomkarte der Gattung Kobuvirus

Die Spezies der Gattung Kobuvirus unterscheiden sich von anderen Mitgliedern der Picornaviridae durch einen sehr langen poly-A-Schwanz von 270 nt und einen sehr hohen Anteil der Nukleotide Guanin und Cytosin (G/C-Anteil) von 59 %. Alle Spezies besitzen am 5'-Ende ihres RNA-Genoms eine Haarnadelstruktur, die für die virale Replikation[3] und die Verpackung[4] des Genoms von Bedeutung ist. Sehr typisch für Kobuviren ist ihre auffällige Struktur bei der Darstellung im Elektronenmikroskop. Im Gegensatz zu anderen Picornaviren ist die ikosaedrische Symmetrie des Kapsids auch in der äußeren Form deutlich zu erkennen. Die Kobuviren haben einen Durchmesser von 27 bis 30 nm.

Das Aichivirus A (früher Aichi-Virus) wird beim Menschen mit einer viralen Gastroenteritis nach dem Genuss von Krebstieren in Verbindung gebracht.[5]

Systematik

Die innere Systematik der Gattung ist nach ICTV mit Stand November 2018,[6] ergänzt um Akronyme nach ViralZone (Stand 2016)[7] und Serotypen nach den ‚Picorornavirus Pages` des Pirbright Institute[8] wie folgt:

  • Genus Kobuvirus
  • Spezies Aichivirus A (AiV-A), ehemals Aichi-Virus (AiV), Typusspezies
  • Aichivirus 1 (en. Aichi virus 1, AiV-1)
  • Felines Kobuvirus 1 (en. Feline kobuvirus 1, FeKV, FEKV-1)
  • Canines Kobuvirus 1 (en. Canine kobuvirus 1, CaKV, CaKV-1)
  • Murines Kobuvirus 1 (en. Murine kobuvirus 1, MKV, MKV-1)
  • Blauracken-Kobuvirus 1 (en. European roller kobuvirus 1, alias Roller kobuvirus, RKV[9], RKV-1)
  • Kathmandu-Abwasser-Kobuvirus (en. Kathmandu sewage kobuvirus)
  • Spezies Aichivirus B (AiV-B), ehemals Bovines Kobuvirus (BKV[9])
  • Bovines Kobuvirus 1 (en. Bovine kobuvirus 1, BKV-1)
  • Frettchen-Kobuvirus 1 (en. Ferret kobuvirus 1, FKV, FKV-1)
  • Schaf-Kobuvirus 1 (alias Ovines Kobuvirus, en. Sheep kobuvirus 1, alias Ovine kobuvirus, OKV, OKV-1)
  • Spezies Aichivirus C (AiV-C), ehemals Porcines Kobuvirus (PKV)
  • Porcines Kobuvirus 1 (en. Porcine kobuvirus 1, PKV-1)
  • Ziegen-Kobuvirus 1 (alias Caprines Kobuvirus 1, en. Caprine kobuvirus 1, CKV, CKV-1)
  • Spezies Aichivirus D (AiV-D)[7]
  • Kagovirus (KV)
  • Spezies Aichivirus E (AiV-E)[7]
  • Kaninchen-Picornavirus (en. Rabbit picornavirus, RKV[9])
  • Spezies Aichivirus F (AiV-F)[7]
  • Fledermaus-Kobuvirus (en. Bat kobuvirus, BKV[9])
  • Keiner Spezies zugeordnete Kobuviren:[7]
  • Rinder-Kobuvirus 1 und 2 (en. Cattle kobuvirus 1, 2)

Literatur
  • T. Yamashita, K. Sakae, H. Tsuzuki, Y. Suzuki, N. Ishikawa, N. Takeda, T. Miyamura, S. Yamazaki: Complete nucleotide sequence and genetic organization of Aichi virus, a distinct member of the Picornaviridae associated with acute gastroenteritis in humans. J Virology (1998) 72(10): S. 8408–8412, PMID 9733894 (Erstbeschreibung)
  • G. Stanway, F. Brown et al.: Genus Kobuvirus. In: C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004, S. 773f
  • T. Yamashita, M. Ito, Y. Kabashima et al.: Isolation and characterization of a new species of kobuvirus associated with cattle. J Gen Virology (2003) 84(Pt 11): S. 3069–3077, PMID 14573811 (frei zugänglicher Artikel mit EM-Bildern)

Einzelnachweise
  1. ICTV Master Species List 2018b.v2. MSL #34, März 2019
  2. ICTV: ICTV Taxonomy history: Enterovirus C, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35).
  3. S. Nagashima, J. Sasaki, K. Taniguchi: The 5'-terminal region of the Aichi virus genome encodes cis-acting replication elements required for positive- and negative-strand RNA synthesis. J Virol. (2005) 79(11): S. 6918–6931, PMID 15890931.
  4. J. Sasaki, K. Taniguchi: The 5'-end sequence of the genome of Aichi virus, a picornavirus, contains an element critical for viral RNA encapsidation. J Virology (2003) 77(6): S. 3542–3548, PMID 12610129.
  5. T. Yamashita, M. Sugiyama et al.: Application of a reverse transcription-PCR for identification and differentiation of Aichi virus, a new member of the Picornavirus family associated with gastroenteritis in humans. J Clin Microbiol. (2000) 38(8): S. 2955–2961, PMID 10921958.
  6. ICTV: Master Species List 2018a v1 (Memento des Originals vom 14. März 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org MSL including all taxa updates since the 2017 release. Fall 2018 (MSL #33).
  7. ViralZone: ICTV 2016 Master Species List #31 with Acronyms, (Excel XLSX), ViralZone, SIB Swiss Institute of Bioinformatics.
  8. Kobuvirus (Memento des Originals vom 19. Februar 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.picornaviridae.com, The Picornavirus Pages 2006–2019, The Pirbright Institute, UK. Abgerufen 18. Februar 2019.
  9. Akronym nicht eindeutig!
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