Kollagen-Typ 20α1

Kollagen Typ XX, alpha 1 ist ein fibrillenassoziiertes Kollagen, das vom Gen COL20A1 codiert wird. Es bildet Homotrimere, die wiederum Kollagenfibrillen vom Typ XX formen.

Kollagen Typ XX, alpha 1
Kollagen Typ XX, alpha 1
Bändermodell von Kollagen Typ XX, alpha 1 nach PDB 2DKM
Andere Namen
  • Alpha-1-Typ-XX-Kollagen
  • Kollagen Alpha-1(XX)-Kette
  • Kollagen Alpha-1-Kette Typ XX

Vorhandene Strukturdaten: PDB 2DKM, PDB 2EE3, PDB 2EKJ

Eigenschaften des menschlichen Proteins
Masse/Länge Primärstruktur 1.284 Aminosäuren, 135.830 Da
Isoformen 3
Bezeichner
Gen-Namen COL20A1 ; BA261N11.4; KIAA1510
Externe IDs
Vorkommen
Homologie-Familie Hovergen
Übergeordnetes Taxon Euteleostomi
Orthologe
Mensch Hausmaus
Entrez 57642 73368
Ensembl ENSG00000101203 ENSMUSG00000016356
UniProt Q9P218 Q923P0
Refseq (mRNA) NM_020882.2 NM_028518.1
Refseq (Protein) NP_065933.2 NP_082794.1
Genlocus Chr 20: 63.29 – 63.33 Mb Chr 2: 180.98 – 181.02 Mb
PubMed-Suche 57642 73368

Eigenschaften

Kollagen Typ XX, alpha 1 befindet sich meistens in der Epithelschicht der Hornhaut, der embryonalen Haut, dem Schwertfortsatz und in der Sehne.[1] Das Gen COL20A1 beeinflusst den Prozess des Zartmachens von Broilerfleisch.[2] Möglicherweise scheint COL20A1 ein Onkogen zu sein.[3]

Einzelnachweise
  1. M. Koch, J. E. Foley, R. Hahn, P. Zhou, R. E. Burgeson, D. R. Gerecke, M. K. Gordon: alpha 1(Xx) collagen, a new member of the collagen subfamily, fibril-associated collagens with interrupted triple helices. In: J Biol Chem. 276. Jahrgang, Nr. 25, 22. Juni 2011, S. 23120–23126, doi:10.1074/jbc.M009912200, PMID 11274142.
  2. K. Piórkowska, K. Żukowski, J. Nowak, K. Połtowicz, K. Ropka-Molik, A. Gurgul: Genome-wide RNA-Seq analysis of breast muscles of two broiler chicken groups differing in shear force. In: Anim Genet. 47. Jahrgang, Nr. 1, Februar 2016, S. 68–80, doi:10.1111/age.12388, PMID 26592359.
  3. Chi-Cheng Huang, Shih-Hsin Tu, Heng-Hui Lien, Jaan-Yeh Jeng, Ching-Shui Huang, Chi-Jung Huang, Liang-Chuan Lai, Eric Y. Chuang: Concurrent gene signatures for han chinese breast cancers. In: PLoS One. 8. Jahrgang, Nr. 10, 3. Oktober 2013, doi:10.1371/journal.pone.0076421, PMID 24098497, PMC 3789693 (freier Volltext).
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