Anelloviridae

Die Anelloviridae sind eine Familie von DNA-Viren. Ihr Genom besteht aus einer ringförmigen (zirkulären) Einzelstrang-DNA negativer Polarität, so wie bei der Virusfamilie Circoviridae, aus der die Anelloviridae 2005/2009 ausgegliedert wurden. Sie haben ein nicht umhülltes Kapsid von abgerundet ikosaedrischer Symmetrie mit T=3-Symmetrie. Ihre Wirte sind Wirbeltiere. Es sind etwa 200 verschiedene Arten bekannt.[1][2] Die (ehemalige) Typusart ist das 1997 entdeckte Torque-Teno-Virus 1 (TTV-1) aus der Gattung Alphatorquevirus.[3]

Anelloviridae

Anelloviridae

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: nicht klassifiziert
Reich: nicht klassifiziert
Phylum: nicht klassifiziert
Klasse: nicht klassifiziert
Ordnung: nicht klassifiziert
Familie: Anelloviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: (-)ssDNA zirkulär
Baltimore: Gruppe 2
Symmetrie: ikosaedrisch
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Anelloviridae
Links
NCBI Taxonomy: 687329
ViralZone (Expasy, SIB): 772
ICTV Taxon History: 201902485

Die Namensbezeichnung ist abgeleitet von italienisch anello ‚Ring‘, was sich auf das zirkuläre Genom der Anelloviridae bezieht.

Genom
Genomkarte der Gattung Alphatorquevirus alias Anellovirus/Torque-Teno-Virus (TTV)
Genomkarte von Torque teno sus virus k2a RS/2 (TTSuV k2a-RS2)[4]

Das Genom ist nicht segmentiert (monopartit), es enthält ein einzelnes Molekül zirkulärer einzelsträngiger DNA mit negativem Polarität. Das gesamte Genom ist 3000–4000 nt lang. Das Genom hat offene Leserahmen (englisch open reading frames, ORFs) und einen hohen Grad an genetischer Diversität.[2]

Replikation

Der Replikationsmechanismus der Anelloviridae scheint die Rolling-circle-Replikation zu sein. Für die Replikation ist eine Wirtspolymerase erforderlich. Das Genom des Virus selbst kodiert nämlich nicht für eine virale Polymerase, weshalb sich die Anelloviren im Zellkern replizieren müssen.[2]

Pathologie

Die Anelloviridae sind weit verbreitet und genetisch vielfältig. Mindestens 200 verschiedene Arten (Spezies) kommen bei Mensch und Tier vor. Sie verursachen chronische menschliche Virusinfektionen, die bisher oft noch nicht mit einer Krankheit in Verbindung gebracht wurden. Mindestens drei Gattungen der Anelloviridae sind mit Infektionen des Menschen verbunden:[1]
  ● das Alphatorquevirus (veraltet Torque-Teno-Virus, TTV)
  ● das Betatorquevirus (veraltet Torque-Teno-Mini-Virus, TTMV)
  ● das Gammatorquevirus (veraltet Torque-Teno-Midi-Virus, TTMDV)
Die Mitglieder der Gattung Gyrovirus infizieren Vögel. Zu diesen gehört auch das bislang (Stand September 2023) ein nicht vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Spezies mit der vorläufigen Bezeichnung „Yellow-eyed penguin gyrovirus“, eine von zwei Virusarten, die den Bestand der neuseeländischen Gelbaugenpinguine gefährden.[5]

Systematik

Die innere Systematik der Anelloviridae ist nach dem International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)[6] mit Stand September 2023 (ergänzt um einige Vorschläge in Anführungszeichen nach der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information, NCBI[7]) wie folgt:

Familie Anelloviridae

  • Gattung Alphatorquevirus (veraltet Anellovirus, Torque-Teno-Virus, TTV)
    • Spezies Torque-Teno-Virus 1 (Torque teno virus 1, TTV-1, wissenschaftlich Alphatorquevirus homin1, ehem. Typusspezies)
    • Spezies Torque teno virus 2 (wiss. Alphatorquevirus homin2)
    • Spezies Torque teno virus 2 (wiss. Alphatorquevirus homin2)
    • Spezies Torque teno virus 3 (wiss. Alphatorquevirus homin3)
    • Spezies Torque teno virus 4 (wiss. Alphatorquevirus homin4)
    • Spezies Torque teno virus 5 (wiss. Alphatorquevirus homin5)
    • Spezies Torque teno virus 6 (wiss. Alphatorquevirus homin6)
    • Spezies Torque teno virus 7 (wiss. Alphatorquevirus homin7)
    • Spezies Torque teno virus 9 (wiss. Alphatorquevirus homin9)
    • Spezies Torque teno virus 10 (wiss. Alphatorquevirus homin10)
    • Spezies Torque teno virus 13 (wiss. Alphatorquevirus homin13)
    • Spezies Torque teno virus 14 (wiss. Alphatorquevirus homin14)
    • Spezies Torque teno virus 15 (wiss. Alphatorquevirus homin15)
    • Spezies Torque teno virus 17 (wiss. Alphatorquevirus homin17)
    • Spezies Torque teno virus 18 (wiss. Alphatorquevirus homin18)
    • Spezies Torque teno virus 19 (wiss. Alphatorquevirus homin19)
    • Spezies Simian torque teno virus 30 (wiss. Alphatorquevirus cerco1, infiziert Chlorocebus aethiops)
    • Spezies Simian torque teno virus 31 (wiss. Alphatorquevirus cerco3)
    • Spezies Simian torque teno virus 32 (wiss. Alphatorquevirus cerco5)
    • Spezies Simian torque teno virus 34 (wiss. Alphatorquevirus cerco2)
    • Spezies „Torque teno virus 8“
    • Spezies „Torque teno virus 11“
    • Spezies „Torque teno virus 12“
    • Spezies „Torque teno virus 16“
    • Spezies „Simian torque teno virus 33“
    • Spezies „Red fox Torque teno virus 2“
  • Gattung Betatorquevirus (veraltet Torque-Teno-Mini-Virus, 13 TTMV-Spezies)
    • Spezies Torque-Teno-Mini-Virus (Torque teno mini virus 1, TTMV-1, wiss. Betatorquevirus homini1, ehem. Typusspezies)
    • Spezies Torque teno mini virus 2 (wiss. Betatorquevirus homini2)
    • Spezies Torque teno mini virus 3 (wiss. Betatorquevirus homini3)
    • Spezies Torque teno mini virus 4 (wiss. Betatorquevirus homini4)
    • Spezies Torque teno mini virus 5 (wiss. Betatorquevirus homini5)
    • Spezies Torque teno mini virus 6 (wiss. Betatorquevirus homini6)
    • Spezies Torque teno mini virus 7 (wiss. Betatorquevirus homini7)
    • Spezies Torque teno mini virus 8 (wiss. Betatorquevirus homini8)
    • Spezies Torque teno mini virus 9 (wiss. Betatorquevirus homini9)
  • Gattung Gammatorquevirus (veraltet Torque-Teno-Midi-Virus, TTMDV)
    • Spezies Torque-Teno-Midi-Virus 1 (Torque teno midi virus 1, TTMDV-1, wiss. Gammatorquevirus homidi1, ehem. Typusspezies)
    • Spezies Torque teno midi virus 2 (wiss. Gammatorquevirus homidi2)
    • Spezies Torque teno midi virus 3 (wiss. Gammatorquevirus homidi3)
    • Spezies Torque teno midi virus 4 (wiss. Gammatorquevirus homidi4)
    • Spezies Torque teno midi virus 5 (wiss. Gammatorquevirus homidi5)
    • Spezies Torque teno midi virus 6 (wiss. Gammatorquevirus homidi6)
    • Spezies Torque teno midi virus 7 (wiss. Gammatorquevirus homidi7)
    • Spezies Torque teno midi virus 8 (wiss. Gammatorquevirus homidi8)
    • Spezies Torque teno midi virus 9 (wiss. Gammatorquevirus homidi9)
  • Gattung Deltatorquevirus
    • Spezies Tupaia-Torque-Teno-Virus (Torque teno tupaia virus, TTV14-Tbc, wiss. Deltatorquevirus tupai1, ehem. Typusspezies)
  • Gattung Epsilontorquevirus
    • Spezies Tamarin-Torque-Teno-Virus (Torque teno tamarin virus, So-TTV2, TTV2-So, wiss. Epsilontorquevirus calli1, infiziert Saguinus oedipus, ehem. Typusspezies)
    • Spezies „Raccoon dog Torque teno virus 1“
  • Gattung Zetatorquevirus
    • Spezies Nachtaffen-Torque-Teno-Virus (TTV3-At, At-TTV3, Torque teno douroucouli virus, wiss. Zetatorquevirus aotid1, infiziert Aotus trivirgatus, ehem. Typusspezies)
  • Gattung Etatorquevirus
    • Spezies Torque teno felis virus-Fc-TTV4 (TTV4-Fc, Torque teno felis virus [1], wiss. Etatorquevirus felid1, ehem. Typusspezies)
    • Spezies Torque teno felis virus 2 (wiss. Etatorquevirus felid2)
    • Spezies Torque teno ocelot virus (wiss. Etatorquevirus felid3)
    • Spezies Torque teno felis virus-Fc-TTV2 (wiss. Etatorquevirus felid4)
    • Spezies Torque teno felis virus-Fc-TTV1 (wiss. Etatorquevirus felid5)
    • Spezies Torque teno viverrid virus 3 (wiss. Etatorquevirus viver3)
  • Gattung Thetatorquevirus
    • Spezies Hunde-Torque-Teno-Virus (Torque teno canis virus, TTV10-Cf, wiss. Thetatorquevirus canid1, ehem. Typusspezies)
    • Spezies Tick associated torque teno virus (wiss. Thetatorquevirus ixodi1)
    • Spezies Pine marten torque teno virus 1 (wiss. Thetatorquevirus muste1)
    • Spezies Torque teno procyo virus 5 (wiss. Thetatorquevirus procy5)
    • Spezies Torque teno procyo virus 6 (wiss. Thetatorquevirus procy6)
    • Spezies Lesser panda anellovirus (wiss. Thetatorquevirus ursid1)
    • Spezies Torque teno ursid virus 2 (wiss. Thetatorquevirus ursid2)
    • Spezies Torque teno ursid virus 3 (wiss. Thetatorquevirus ursid3)
    • Spezies Torque teno ursid virus 4 (wiss. Thetatorquevirus ursid4)
    • Spezies Torque teno viverrid virus 4 (wiss. Thetatorquevirus viver4)
    • Spezies „Nayun tick torquevirus“ (wiss. „Thetatorquevirus HX-2015“)
    • Spezies „Red fox Torque teno virus 1“
  • Gattung Iotatorquevirus
    • Spezies Schweine-Torque-Teno-Virus (Torque teno sus virus 1a, Porcine torque teno virus 1, Sd-TTV31, TTV31-Sd, wiss. Iotatorquevirus suida1a, ehem. Typusspezies)
    • Spezies Torque teno sus virus 1b (Porcine torque teno virus 2, wiss. Torque teno sus virus 1b)
  • Gattung Kappatorquevirus
    • Spezies Torque teno sus virus k2a (wiss. Kappatorquevirus suidak2a , ehem. Typusspezies)[8], mit Torque teno sus virus k2a RS/2 (TTSuV k2a-RS2)[4]
    • Spezies Torque teno sus virus k2b (wiss. Kappatorquevirus suidak2b)
  • Gattung Lambdatorquevirus
    • Spezies Torque teno pinniped virus 1 (wiss. Lambdatorquevirus phoci1)
    • Spezies Seal anellovirus 2 (wiss. Lambdatorquevirus phoci2)
    • Spezies Seal anellovirus 3 (wiss. Lambdatorquevirus phoci3, mit Seal anellovirus 6 und Seal anellovirus 7)
    • Spezies Torque teno Leptonychotes weddellii virus 1 (wiss. Lambdatorquevirus phoci5)
    • Spezies Torque teno Leptonychotes weddellii virus 2 (wiss. Lambdatorquevirus phoci6)
    • Spezies „Torque teno Leptonychotes weddellii virus 2“
    • Spezies „Torque teno Leptonychotes weddellii virus 3“
  • Gattung Mutorquevirus
    • Spezies Torque teno equus virus 1 (wiss. Mutorquevirus equid1, ehem. Typusspezies)
    • Spezies Torque teno equus virus 2 (wiss. Mutorquevirus equid2)
  • Gattung Nutorquevirusv
    • Spezies Torque teno pinniped virus (wiss. Nutorquevirus phoci4, ehem. Typusspezies, mit Seal anellovirus 5)
    • Spezies „Torque teno seal virus 4“ (mit Seal anellovirus 4)
  • Gattung Xitorquevirus
    • Spezies Torque teno didelphis albiventris virus (wiss. Xitorquevirus didel1)
    • Spezies Torque teno Tadarida brasiliensis virus (wiss. Xitorquevirus molos1)
  • Gattung Omicrontorquevirus
    • Spezies Torque teno ursid virus 5 (wiss. Omicrontorquevirus ursid5)
    • „Spezies Grizzly bear anellovirus 9“
  • Gattung Pitorquevirus
    • Spezies Torque teno ursid virus 7 (wiss. Pitorquevirus ursid7)
    • Spezies Torque teno ursid virus 8 (wiss. Pitorquevirus ursid8)
    • Spezies Torque teno ursid virus 9 (wiss. Pitorquevirus ursid9)
    • Spezies Torque teno ursid virus 10 (wiss. Pitorquevirus ursid10)
    • Spezies Torque teno ursid virus 11 (wiss. Pitorquevirus ursid11)
    • Spezies Torque teno ursid virus 12 (wiss. Pitorquevirus ursid12)
  • Gattung Rhotorquevirus
    • Spezies Torque teno rodent virus 1 (wiss. Rhotorquevirus murid1)
  • Gattung Sigmatorquevirus
    • Spezies Torque teno zalophus virus 1 (wiss. Sigmatorquevirus otari1, ehem. Typusspezies, mit California sea lion anellovirus)
    • Spezies Torque teno Arctocephalus gazella virus 1 (wiss. Sigmatorquevirus otari2)
    • Spezies Torque teno Arctocephalus gazella virus 2 (wiss. Sigmatorquevirus otari3)
  • Gattung Chitorquevirus
    • Spezies Torque teno indriid virus 1 (wiss. Chitorquevirus indri1)
  • Gattung Psitorquevirus
    • Spezies Torque teno procyo virus 4 (wiss. Psitorquevirus procy4)
  • Gattung Omegatorquevirus
    • Spezies Gorilla anellovirus (wiss. Omegatorquevirus hominid1)
  • Gattung Aleptorquevirus
    • Spezies Torque teno arthrovec virus 1 (wiss. Aleptorquevirus culic1)
    • Spezies Torque teno leprid virus 1 (wiss. Aleptorquevirus lepor1)
  • Gattung Gimeltorquevirus
    • Spezies Torque teno virus 30 (wiss. Gimeltorquevirus ursid13)
  • Gattung Dalettorquevirus
    • Spezies Torque teno ursid virus 6 (wiss. Dalettorquevirus ursid6)
  • Gattung Hetorquevirus
    • Spezies Torque teno hominid virus 2 (wiss. Hetorquevirus hominid2)
  • Gattung Wawtorquevirus
    • Spezies Torque teno rodent virus 6 (wiss. Wawtorquevirus crice1)
    • Spezies Torque teno rodent virus 2 (wiss. Wawtorquevirus crice2)
    • Spezies Torque teno rodent virus 3 (wiss. Wawtorquevirus crice3)
    • Spezies Torque teno arthrovec virus 2 (wiss. Wawtorquevirus culic2)
    • Spezies Torque teno rodent virus 4 (wiss. Wawtorquevirus murid2)
    • Spezies Torque teno rodent virus 5 (wiss. Wawtorquevirus murid3)
  • Gattung Zayintorquevirus
    • Spezies Torque teno viverrid virus 1 (wiss. Zayintorquevirus viver1)
    • Spezies Torque teno viverrid virus 5 (wiss. Zayintorquevirus viver5)
  • Gattung Tettorquevirus
    • Spezies Katzen-Torque-Teno-Virus (Torque teno felid virus 6, wiss. Tettorquevirus felid6)
  • Partikel von Gyrovirus, schema­tischer Aufbau
    Hühneranämievirus-Partikel, Aufsicht
    Gattung Gyrovirus[9]
    • Spezies Hühneranämievirus (Chicken anemia virus, CAV, wiss. Gyrovirus chickenanemia, ehem. Typusspezies)[10][11]
    • Spezies Gyrovirus fulgla1 (veraltet Gyrovirus GyV8)
    • Spezies Gyrovirus galga1 (mit Avian gyrovirus 2 und Human gyrovirus 1)
    • Spezies Gyrovirus galga2 (veraltet Gyrovirus GyV7-SF)
    • Spezies Gyrovirus homsa1 (veraltet Gyrovirus GyV3)
    • Spezies Gyrovirus homsa2 (veraltet Gyrovirus Tu789)
    • Spezies Gyrovirus homsa3 (veraltet Gyrovirus 4)
    • Spezies Gyrovirus homsa4 (veraltet Gyrovirus Tu243)
    • Spezies Ashy storm petrel gyrovirus (wiss. Gyrovirus hydho1** Spezies Gyrovirus myferr1)
    • Spezies Gyrovirus myferr1 (veraltet Gyrovirus 11)
    • Spezies „Avian gyrovirus 13“
    • Spezies „Grey teal gyrovirus“
    • Spezies „Gyrovirus 10“
    • Spezies „Gyrovirus 3“
    • Spezies „Gyrovirus 6“
    • Spezies „Gyrovirus 9“
    • Spezies „Gyrovirus GyV9“
    • Spezies „Gyrovirus VC5“
    • Spezies „Gyrovirus VC7“
    • Spezies „Pheasant-associated gyrovirus“
    • Spezies „Pigeon gyrovirus“
    • Spezies „Vulpes vulpes-associated gyrovirus“
    • Spezies „Yellow-eyed penguin gyrovirus“ (infiziert den Gelbaugenpinguin Megadyptes antipodes)[5]
  • ohne Gattungszuordnung (doppelte Anführungszeichen für Vorschläge)[12]

Bei einigen artenreichen Gattungen ist nur eine Auswahl der Mitglieder angegeben. Die Namen von vorgeschlagenen Spezies folgen oft noch nicht der bei Viren neuen binären Namenskonvention frei nach Carl von Linné.

Einzelnachweise
  1. F. Bernardin, E. Operskalski, M. Busch, E. Delwart: Transfusion transmission of highly prevalent commensal human viruses. In: Transfusion. Band 50, Nr. 11, Mai 2010, S. 2474–2483, doi:10.1111/j.1537-2995.2010.02699.x, PMID 20497515 (englisch).
  2. ViralZone: Anelloviridae. ExPASy, abgerufen am 31. August 2019 (englisch).
  3. Evgeny V. Vasilyev, Dmitry Y. Trofimov, Alexander G. Tonevitsky, Valery V. Ilinsky, Dmitriy O. Korostin, Denis V. Rebriko: Torque Teno Virus (TTV) distribution in healthy Russian population. In: Virology Journal. 6. Jahrgang, 7. September 2009, S. 134, doi:10.1186/1743-422X-6-134, PMID 19735552, PMC 2745379 (freier Volltext) – (englisch).
  4. Caroline Tochetto, Ana Paula Muterle Varela, Diane Alves de Lima, Márcia Regina Loiko, Camila Mengue Scheffer, Willian Pinto Paim, Cristine Cerva, Candice Schmidt, Samuel Paulo Cibulski, Lucía Cano Ortiz, Sidia Maria Callegari Jacques, Ana Cláudia Franco, Fabiana Quoos Mayer, Paulo Michel Roehe: Viral DNA genomes in sera of farrowing sows with or without stillbirths, in: PLoS ONE 15(3), e0230714, 26. März 2020, doi:10.1371/journal.pone.0230714
  5. Janelle R. Wierenga, Kerri J. Morgan, Stuart Hunter, Harry S. Taylor, Lisa S. Argilla, Trudi Webster, Jeremy Dubrulle, Fátima Jorge, Mihnea Bostina, Laura Burga, Edward C. Holmes, Kate McInnes, Jemma L. Geoghegan: A novel gyrovirus is abundant in yellow-eyed penguin (Megadyptes antipodes) chicks with a fatal respiratory disease. In: Virology, Band 579, Februar 2023, S. 75–83; doi:10.1016/j.virol.2022.12.012, PMID 36608597, Epub 2. Januar 2023 (englisch). Dazu:
  6. ICTV: Taxonomy Browser, abgerufen am 28. September 2023.
  7. NCBI Taxonomy Browser: Anelloviridae.
  8. NCBI: Torque teno sus virus k2a (species)
  9. SIB: Gyrovirus, auf: ViralZone
  10. Science Direct: Anelloviridae. „Members of the family Anelloviridae have features in common with Chicken anaemia virus, the type species of genus Gyrovirus, family Circoviridae“
  11. Michael J. Tisza, Diana V. Pastrana, Nicole L. Welch, Brittany Stewart, Alberto Peretti, Gabriel J. Starrett, Yuk-Ying S. Pang, Siddharth R. Krishnamurthy, Patricia A. Pesavento, David H. McDermott, Philip M. Murphy, Jessica L. Whited, Bess Miller, Jason Brenchley, Stephan P. Rosshart, Barbara Rehermann, John Doorbar, Blake A. Ta'ala, Olga Pletnikova, Juan C. Troncoso, Susan M. Resnick, Ben Bolduc, Matthew B. Sullivan, Arvind Varsani, Anca M. Segall, Christopher B. Buck: Discovery of several thousand highly diverse circular DNA viruses, in: eLife 9, 4. Februar 2020, e51971; doi:10.7554/eLife.51971. Fig. 2
  12. NCBI Taxonomy Browser: unclassified Anelloviridae.
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